Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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