Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
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DDB1Q16531 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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