Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GABRA6Q16445 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GABRA6Q16445 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GABRA6Q16445 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GABRA6Q16445 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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