Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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EFNB3Q15768 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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EFNB3Q15768 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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EFNB3Q15768 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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