Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.51
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