Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CLCA4Q14CN2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CLCA4Q14CN2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CLCA4Q14CN2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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