Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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