Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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UBE4AQ14139 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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UBE4AQ14139 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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UBE4AQ14139 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
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UBE4AQ14139 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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UBE4AQ14139 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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UBE4AQ14139 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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UBE4AQ14139 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
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