Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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