Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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TUBA3CQ13748 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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TUBA3CQ13748 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA3CQ13748 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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