Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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