Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ERCC8Q13216 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ERCC8Q13216 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ERCC8Q13216 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ERCC8Q13216 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ERCC8Q13216 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ERCC8Q13216 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ERCC8Q13216 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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