Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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