Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFEMP1Q12805 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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