Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMA1Q12791 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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KCNMA1Q12791 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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