Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBQ06643 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBQ06643 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms