Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG1Q06432 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms