Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELAQ04206 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELAQ04206 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELAQ04206 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELAQ04206 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELAQ04206 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RELAQ04206 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RELAQ04206 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RELAQ04206 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RELAQ04206 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms