Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ERCC6Q03468 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms