Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms