Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OC90Q02509 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms