Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms