Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms