Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms