Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms