Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms