Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AIF1P55008 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AIF1P55008 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AIF1P55008 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AIF1P55008 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AIF1P55008 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AIF1P55008 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AIF1P55008 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AIF1P55008 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AIF1P55008 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AIF1P55008 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AIF1P55008 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AIF1P55008 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AIF1P55008 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AIF1P55008 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AIF1P55008 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms