Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms