Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF6P49848 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF6P49848 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF6P49848 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms