Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RANGAP1P46060 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms