Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms