Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDH1P40925 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDH1P40925 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDH1P40925 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDH1P40925 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDH1P40925 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDH1P40925 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MDH1P40925 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDH1P40925 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDH1P40925 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MDH1P40925 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDH1P40925 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDH1P40925 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDH1P40925 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDH1P40925 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDH1P40925 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDH1P40925 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MDH1P40925 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDH1P40925 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MDH1P40925 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDH1P40925 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDH1P40925 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDH1P40925 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDH1P40925 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDH1P40925 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms