Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJC1P36383 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms