Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms