Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GDI1P31150 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDI1P31150 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDI1P31150 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GDI1P31150 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDI1P31150 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDI1P31150 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDI1P31150 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms