Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms