Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT1P26358 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms