Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LMO1P25800 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LMO1P25800 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LMO1P25800 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMO1P25800 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LMO1P25800 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMO1P25800 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMO1P25800 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMO1P25800 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMO1P25800 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMO1P25800 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO1P25800 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO1P25800 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO1P25800 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO1P25800 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO1P25800 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO1P25800 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO1P25800 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO1P25800 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO1P25800 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMO1P25800 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO1P25800 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMO1P25800 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms