Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms