Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNNI3P19429 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms