Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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