Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DESP17661 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DESP17661 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DESP17661 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DESP17661 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DESP17661 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DESP17661 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DESP17661 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DESP17661 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DESP17661 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DESP17661 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DESP17661 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DESP17661 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DESP17661 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DESP17661 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms