Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms