Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYF2O95926 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYF2O95926 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYF2O95926 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYF2O95926 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms