Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18L1O75177 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms