Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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