Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms