Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHMP2AO43633 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHMP2AO43633 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP2AO43633 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms