Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF1O43189 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF1O43189 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF1O43189 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF1O43189 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF1O43189 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF1O43189 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms