Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD51BO15315 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms